司徒亮是新中国成立后第一版妇产科教材的编委之一。
然而,随之而来的接触污染物、缺乏绿地和生活拥挤等环境暴露的剧烈转变也成为城市居民不得不面临的新挑战。研究获得欧洲地平线项目、欧洲研究理事会项目、国家自然科学基金、科技部重点研发计划、上海市脑与类脑智能基础转化应用研究市级科技重大专项、欧洲脑计划等项目的支持 制图:实习编辑:罗钰责任编辑:李斯嘉。
通过对城市环境与情绪症状模块化关联的全基因组关联分析,研究发现被试携带不同的应激反应基因风险,如CRHR1,则会表现出城市环境-脑-情绪症状之间的易感性差异。NatureMedicine编辑团队邀请该领域专家对该成果进行专篇新闻与评论报道,题为Urban living and mental health(图三)。瑞典厄勒布鲁大学Brittany E. Evans, Catherine Tuvblad和 Henrik Larsson教授接受Nature Medicine编辑团队邀请对该成果进行专篇新闻与评论报道。复旦大学冯建峰教授、天津医科大学于春水教授、荷兰奈梅亨拉德堡德大学Andre Marquand教授为本文做出同等贡献。图三:专篇新闻与评论报道这项研究考虑到城市环境的内在复杂性,在解读城市生活环境与精神健康之间的关联迈出了至关重要的一步。
同时,第二类城市环境模块,包括城市基建与绿色暴露,则通过影响情绪调节相关脑区的结构(如前额叶和边缘系统脑区),引起焦虑症状群。此外,研究者进一步提供了城市环境与精神症状之间模块化关联的确凿的神经机制,为后续研究提供了重要方向。研究人员评估了17种不同的神经疾病(neurological disorder)、精神疾病(psychiatric disorder)和行为认知表型(behavioral-cognitive trait)在每一种神经细胞和脑区中活跃的非编码调控元件中的遗传力(genetic heratability)富集程度。
非编码调控元件(cis-regulatory element)和功能性遗传变异对于人脑发育及其健康维持至关重要。研究发现,通过EPI网络识别出的脑疾病相关基因与已知的脑疾病风险基因具有很高的重合度。该研究基于FANTOM5计划(FANTOM计划的第五阶段)的439种不同的人类细胞/组织类型的RNA表达活性数据,基于机器学习方法对每一种细胞/组织类型中的EPI网络进行了重构,并利用其他来源的功能基因组学数据系统评估了重构出的EPI网络的可靠性。基于这种假设,研究人员整合脑疾病的GWAS数据,对脑疾病相关的基因进行了系统预测。
研究发现,神经疾病大多在神经干细胞和星形胶质细胞中具有显著的遗传力富集, 而精神疾病和行为认知表型则在神经元中具有遗传力富集,此外还发现精神疾病在发育早期的大脑中具有更强的遗传力富集,暗示了不同的脑疾病类型可能具有不同的细胞和发育基础研究发现,神经疾病大多在神经干细胞和星形胶质细胞中具有显著的遗传力富集, 而精神疾病和行为认知表型则在神经元中具有遗传力富集,此外还发现精神疾病在发育早期的大脑中具有更强的遗传力富集,暗示了不同的脑疾病类型可能具有不同的细胞和发育基础。
基于这种假设,研究人员整合脑疾病的GWAS数据,对脑疾病相关的基因进行了系统预测。研究人员评估了17种不同的神经疾病(neurological disorder)、精神疾病(psychiatric disorder)和行为认知表型(behavioral-cognitive trait)在每一种神经细胞和脑区中活跃的非编码调控元件中的遗传力(genetic heratability)富集程度。进一步的分析发现,识别出的脑疾病相关基因在精神疾病和行为认知表型之间表现出广泛的基因多效性(genetic pleiotropy),同时富集与突触功能和神经系统发育相关的功能,并且与神经疾病相关基因体现出很大的差异。研究发现,重构的EPI网络显示出极强的细胞/组织类型特异性的聚集,并且与神经细胞/组织中活跃的非编码调控元件相结合的转录因子(TF)在突触可塑性和神经发育中起关键作用,如EGR1和SOX家族。
人类基因组中已经发现了超过百万个非编码调控元件,包括增强子(enhancer)、启动子(promoter)等。该研究基于FANTOM5计划(FANTOM计划的第五阶段)的439种不同的人类细胞/组织类型的RNA表达活性数据,基于机器学习方法对每一种细胞/组织类型中的EPI网络进行了重构,并利用其他来源的功能基因组学数据系统评估了重构出的EPI网络的可靠性。进一步,研究人员利用重构的EPI网络对脑疾病的风险基因进行了精准预测。在机制上,增强子往往调控远端的特定启动子,因此,位于增强子内部的潜在功能性遗传变异可以通过EPI网络与其特定的靶基因进行关联。
本研究为理解脑疾病和行为认知表型的遗传调控机制提供了新见解。2023年7月24日,复旦大学类脑智能科学与技术研究院赵兴明教授团队在Genome Medicine上发表题为Prioritizing genes associated with brain disorders by leveraging enhancer-promoter interactions in diverse neural cells and tissues(利用多种神经细胞和组织中的增强子-启动子相互作用定位脑疾病相关的基因)的研究论文。
增强子与启动子之间会形成复杂的互作网络(enhancer-promoter interaction,EPI),对于细胞组织特异性的基因表达具有重要的调控作用,并且与特定的疾病表型密切相关。复旦大学类脑智能科学与技术研究院博士生赵兴忠和宋利婷博士为论文的共同第一作者,赵兴明教授和杨禹丞青年副研究员为本文的通讯作者。
非编码调控元件(cis-regulatory element)和功能性遗传变异对于人脑发育及其健康维持至关重要。研究发现,通过EPI网络识别出的脑疾病相关基因与已知的脑疾病风险基因具有很高的重合度。综上所述,本研究构建了人脑中的非编码调控元件互作网络的概览图,分析了其在神经细胞和组织中的特异性,并据此对脑疾病基因进行了系统而精准的定位。本课题受到国家重点研发计划、国家自然科学基金、上海市市级科技重大专项等经费资助这位女孩就是今年被保研到复旦大学信息科学与工程学院生物医学专业的新生吴玉其。因为不想孩子有压力,也不求回报,只希望她顺利完成学业,他当年拒绝了采访,捐助也一直以匿名的方式进行。
张少民也从事产品技术相关的工作,得知吴玉其的专业偏向硬件制造,他叮嘱说:这正符合国家发展的需要,国家也缺少这样的人才,你一定要在复旦打牢基础,这将对你今后的工作大有助益。她很乖,从幼儿园开始就不断拿奖状回家,后来家里老房子拆了我想把她以前的奖状扔掉一些,她都不肯,一张张捡回来,母亲潘惠珍说。
四年的努力,吴玉其获得了保送研究生的资格,通过参加复旦大学信息科学与工程学院全国优秀大学生夏令营拿到了优秀营员,扎实的理论基础、优秀的科研能力让她被录取到生物医学工程专业(学术学位)。找到这位好心人成了吴玉其心里一直放不下的事。
因为有了你的资助,帮助我解决了经济的问题,让我能安心读书,参加校园活动,得到了一个圆满的大学生活吴玉其说道。大学期间她就曾想,联系到捐助者,但没有实现。
2019年,海宁市当地媒体发起了助学资助项目,当时刚考入兰州大学的吴玉其成为被资助的学子之一。未来,我希望能够利用复旦的优质平台,全面提升自己的科研能力。如今,终于见到了一直想见的人,吴玉其的感谢都凝结在见面时深深鞠的一躬里。制图:实习编辑:孙一诺责任编辑:李斯嘉。
吴玉其的到来,对张少民来说是打破平静日常工作的意外惊喜,没想到孩子会辗转找到我,看到她的成绩,我开心的感觉没有办法用语言来描述,她有出息,我觉得很值得。7月初,当吴玉其收到复旦大学研究生录取通知书后,她再次联系当地记者,决定找到4年来一直资助她的人,当面说一声谢谢。
7月26日,一条保研后被资助女孩找到神秘汇款人的消息刷屏,人间值得善意流传娃娃争气......网友纷纷为资助者的善意、女孩的励志与感恩之心点赞。拿出录取通知书,吴玉其向张少民说起了自己未来的打算,生物医学工程是应用性较强的专业,相关技术研究又是国家所需,理论研究上和我大学所学电子信息科学技术底层逻辑相通。
在报纸上得知吴玉其的故事,又从女儿口中了解到吴玉其生活上非常节俭,成绩在班级也名列前茅,这么刻苦、上进的孩子值得资助。她很喜欢汪国真的一句话,既然选择了远方,便只顾风雨兼程。
从2019年9月到今年6月,连续四年,这笔每月都会来的汇款,在吴玉其的大学生活中从未缺席。家庭的变故,让她自小就独立自强。和女儿、妻子商量后,张少民做出了资助的决定。复旦大学是国内最早开展生物医学工程研究的单位之一,形成了理、工、医紧密结合互相渗透的特色,学科重点研究智慧医疗电子与信息、康复工程与新型医用材料、类脑科学与医疗机器人等方向,在打牢学生扎实数理基础的同时,更注重科学素质和创新能力的培养。
递上感谢信,吴玉其从包里拿出了一摞厚厚的奖状国家奖学金、国家励志奖学金、学生标兵、兰州大学2023届优秀毕业生......专业成绩年级第二、参加校级和国家级、大学生创新创业训练计划项目、发表论文、申请专利、获得蓝桥杯全国软件和信息技术专业人才大赛二等奖、参与留守儿童手拉手结对帮扶活动、担任班级和学生会干部,她还汇报了本科期间的学习、科研、学生工作的情况。因为家庭的原因,吴玉其从小得到的东西并不多,她希望可以靠自己闯出一番天地,追求理想时,也遇到很多困难,慢慢我发现,当下可能有困难,但如果迎难而上的话,困难也就过去了。
在吴玉其三个月大时,父亲因车祸离世,母亲悲伤过度导致双耳失聪。几经周折,吴玉其找到了这位捐助者,让她颇感意外的是,好心人就是自己中学同班好友张鸿敏的父亲——张少民。
张叔叔,真的谢谢你,7月21日,在母亲的陪伴下,吴玉其终于见到这位神秘的汇款人,深深鞠上一躬,说出了埋藏在心底4年的话。他还特地嘱咐吴玉其,如果读研期间,经济上碰到难处,一定要找我。
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